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Co-IP + LC-MS
鉴于蛋白质相互作用的多样性、动态性,因此,将免疫沉淀技术(Co-IP)和LC-MS有机结合,高通量、系统性的解析特定蛋白质的相互作用网络,具有显著的技术优势,体现在:(1)能真正从系统学层面上解析蛋白质相互作用的复杂、动态网络。免疫沉淀复合物通过LC-MS鉴定,至少能鉴定到几百个蛋白质,排除一些非特异性的相互作用,至少能筛选出几十到上百个潜在的、与目的蛋白相互作用分子。非常有利于系统理解特定蛋白质及其相互作用网络与细胞生理功能的关系;有助于快速锁定相互作用目标分子。通过LC-MS的鉴定结果,能一目了然的明晰样品到底有哪些蛋白质,看到了,就能更好的去选择和验证,方向更为明确,实验成功率显著提高;研究方向和目标更具系统性。因为通过一次LC-MS实验,至少能鉴定几十个潜在的、与目的蛋白相互作用的分子,建立属于自己的、独有的相互作用数据库。分别对这些潜在的相互作用进行深入的生物学功能实验分析,能发表一系列连续的学术文章,使研究者的成果更为系统。
ITRAQ/TMT
ITRAQ/TMT技术是一种新的、功能强大的可同时对四种样品进行绝对和相对定量研究的方法。在串联质谱中,信号离子表现为不同质荷比(114~117)的峰,因此,根据波峰的高度及面积,可以得到蛋白质的定量信息。虽然DIGE和ICAT已经广泛应用于蛋白质研究,但是ITRAQ/TMT作为一种新的蛋白质绝对和相对定量技术,具有很好的精确性和重复性,并且弥补了DIGE及ICAT的不足。同时,该技术结合非凝胶串联质谱技术,对复杂样本、细胞器、细胞裂解液等样本进行相对定量研究。寻找差异表达蛋白,并分析蛋白功能。
DIGE-2D
采用双向电泳DIGE荧光差异蛋白表达分析系统,对不同类型,不同个体细胞、组织、或经过不同处理和不同生长条件下的蛋白质表达差异的分析,以研究疾病的分子机理、分子诊断、药物作用机理等。
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